Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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