Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
GRIN2BQ13224 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIN2BQ13224 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms