Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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CALCOCO2Q13137 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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CALCOCO2Q13137 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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CALCOCO2Q13137 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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CALCOCO2Q13137 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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CALCOCO2Q13137 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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CALCOCO2Q13137 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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