Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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