Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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SMARCB1Q12824 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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SMARCB1Q12824 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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