Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFFO1Q0D2I5 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms