Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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