Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3DQ96BQ1 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms