Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms