Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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