Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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HIF1AQ16665 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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HIF1AQ16665 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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HIF1AQ16665 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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HIF1AQ16665 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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HIF1AQ16665 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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