Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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