Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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