Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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