Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms