Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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