Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms