Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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TCOF1Q13428 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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TCOF1Q13428 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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TCOF1Q13428 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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TCOF1Q13428 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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TCOF1Q13428 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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TCOF1Q13428 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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TCOF1Q13428 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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