Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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SGCGQ13326 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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SGCGQ13326 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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SGCGQ13326 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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