Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATMQ13315 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATMQ13315 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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