Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
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SKP2Q13309 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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SKP2Q13309 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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SKP2Q13309 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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SKP2Q13309 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SKP2Q13309 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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