Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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RIGQ13278 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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RIGQ13278 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RIGQ13278 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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RIGQ13278 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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RIGQ13278 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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