Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MAP3K1Q13233 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
MAP3K1Q13233 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MAP3K1Q13233 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MAP3K1Q13233 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MAP3K1Q13233 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MAP3K1Q13233 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MAP3K1Q13233 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MAP3K1Q13233 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms