Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.9 ms