Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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FOXF1Q12946 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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FOXF1Q12946 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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FOXF1Q12946 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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