Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms