Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms