Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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