Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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