Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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