Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms