Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ALX1Q15699 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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ALX1Q15699 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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ALX1Q15699 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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ALX1Q15699 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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