Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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