Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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HERC3Q15034 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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