Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CNGB1Q14028 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CNGB1Q14028 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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CNGB1Q14028 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CNGB1Q14028 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CNGB1Q14028 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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CNGB1Q14028 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CNGB1Q14028 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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