Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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