Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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