Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms