Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATRQ13535 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
ATRQ13535 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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