Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PICALMQ13492 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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