Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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