Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms