Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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