Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.55□□□□□ -2
STX4Q12846 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.55□□□□□ -2
STX4Q12846 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
STX4Q12846 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.55□□□□□ -2
STX4Q12846 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.55□□□□□ -2
STX4Q12846 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
STX4Q12846 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
STX4Q12846 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
STX4Q12846 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
STX4Q12846 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
STX4Q12846 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
STX4Q12846 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
STX4Q12846 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms