Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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