Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms