Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTIFO43310 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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