Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm3839S4R1W1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm3839S4R1W1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm3839S4R1W1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm3839S4R1W1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm3839S4R1W1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm3839S4R1W1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm3839S4R1W1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gm3839S4R1W1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm3839S4R1W1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm3839S4R1W1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm3839S4R1W1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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