Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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