Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms